Kegiatan Jum`at berdoa merupakan salah satu pembiasaan di Madrasah Ibtidaiyah Modern Al Azhary. Pada kegiatan ini para peserta didik melaksanakan kegiatan berdoa yang yang sesuai dengan amalan  dari pengurus yayasan  yaitu Ahlisunah Waljamah.

Setiap hari jumat para peserta didik dari kelas 3 -6 mengikuti pembacaan doa untuk para orang tua, guru dan pendiri yayasan yang telah meninggal.

Kegiatan doa ini juga di pimpin oleh guru agama dan guru lain yang telah di tunjuk sesuai dengan jadwal .